Para hacer que Zend IDE se inicie más rápido, simplemente desactiva todos los módulos que se inicializan en el arranque.
Ventana -> Preferencias -> General -> Inicio y Apagado
Y desmarca todo
Para evitar que Zend IDE utilice la Preparación de Git, simplemente elimínalo del inicio predeterminado.
Ventana -> Preferencias -> Equipo -> Git -> Confirmación
Y desmarca la primera casilla "Usar la Vista de Preparación para confirmar en lugar del Diálogo de Confirmación"